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Improving the infrastructure for medical research

An efficient, high-quality infrastructure is a major precondition for cutting-edge research. The principal aim of the TMF is therefore to improve the organization and infrastructure for networked medical, i.e. clinical, epidemiological and translational, research. The notion of infrastructure as an integral part of research goes well beyond purely technological issues. Accordingly, the TMF activities, projects and products can be grouped into central topics – from frameworks and IT infrastructure through quality management and biobanking to questions relating to network management and public relations.

A large majority of the TMF's work is carried out in numerous projects which, for the most part, are initiated by members and supervised by the working groups. Suggestions for new projects go through a selection process that comprises several stages – from technical evaluation and fine-tuning in the project groups and working groups through consultation in the TMF Office and assessment by the Board of Directors. This process ensures that the problems addressed in the projects are of relevance to the research community and that the solution being pursued finds a broad consensus for subsequent application.

All the TMF projects are listed below in descending chronological order. Click on the submenu items for a short description and details of the related TMF projects and products.

 

  1. TMF-List of Products with Commentaries [pdf | 48 KB]

 

 

D135-01 (CandActCFTR)

Curated database of candidate therapeutics for the activation of CFTR-mediated ion conductance (CandActCFTR)

[Drittmittelprojekte | laufend] Das Projekt »Curated database of candidate therapeutics for the activation of CFTR-mediated ion conductance (CandActCFTR)« mit deutschem Titel »CandActCFTR, eine Datenbank für Wirkstoffe, die die Funktion von CFTR bei Mukoviszidose verbessern« ist Teil der DFG-Fördermaßnahme zur »Förderung von Forschungsprojekten über die und mit der TMF«.

CandActCFTR ist ein Pilotprojekt zum Aufbau einer Datenbank von Kandidaten für Mukoviszidose-Therapeutika zur Aktivierung der CFTR-vermittelten Ionenleitfähigkeit, um Daten aus öffentlich zugänglichen Quellen, unveröffentlichte Primärdaten und Erkenntnisse aus Screening-Bemühungen zusammenzuführen. Die gewonnenen Informationen über getestete Substanzen werden die Identifizierung der vielversprechendsten Kandidaten für zukünftige Therapeutika ermöglichen. CandActCFTR soll demonstrieren, dass die gemeinsame Analyse von Daten für eine zielgerichtete pharmakologische Anwendung erfolgreich realisiert werden kann, während gleichzeitig die geistigen Eigentumsrechte jedes einzelnen Forschers respektiert werden.
 

Aktivitäten und Fortschritt 2020

  • Einbindung von Ähnlichkeitssuchen für Liganden
  • Verbesserung der GUI
  • Integration von KNIME als Teil des Backends
  • Erstellung eines Systembiologiemodels nach MIRIAM-Standard
  • Konzept eines Erklärfilms
     

Ausblick 2021

  • Einbau der Systembiologiemodellierung nach MIRIAM-Standard in die GUI
  • Erstellung des Zielstrukturdatenbankmoduls und Befüllen der Datenbank
  • Virtuelles Screening (Bindestellenvorhersagen und Docking) mit Annotation der Datenbank mit den Ergebnissen (Ligand mit Zielstruktur(en))
  • Fertigstellung eines Erklärfilms zur Vermarktung der Software
     

Projektleitung:

Dr. Manuel M. Nietert, Universitätsmedizin Göttingen, PD Dr. Frauke Stanke, Medizinische Hochschule Hannover
 

Projektzeitraum:

2016 – 2022
 

Bewilligte Mittel (Anteil TMF):

siehe »Zentralprojekt zu DFG-Forschungsprojekten über die und mit
der TMF«
 

Förderer:

Deutsche Forschungsgemeinschaft DFG | Projektnummer 315063128


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